ゲノム大規模解析システム 一式
入札情報
- 品目分類：24
- 種別：意見招請
- 調達方法 購入等
- 導入予定時期 平成22年度12月以降
- 調達に必要とされる基本的な要求要件 ゲノム大規模解析システムは、次世代ＤＮＡシークエンサーとデータ解析サーバから構成される。シロイヌナズナ等モデル植物のゲノムＤＮＡ配列解析、ChIP-seq (クロマチン免疫沈降配列解析）、ＲＮＡ-seq（網羅的遺伝子発現解析）、マルチプレックス法によるＤＮＡ配列解析を行うことを目的とする。本システムは基礎生物学研究所・生物機能解析センター（共通棟Ｉ）に設置する。本装置の要求要件は次の6項目である。次世代ＤＮＡシークエンサーについて:Ａ 各ＤＮＡ断片あたり100塩基を98％以上の正確性で読み取れ、片側または両側からの読み取り方式を選択できること。Ｂ 8レーンのフローセルが2枚までセットでき、8日で150Ｇ塩基以上の読み取り容量と速度を持つことＣ ＤＮＡの読み取りは、固相式試料増幅装置で増幅しフローセルに固定化したＤＮＡ断片を鋳型に4色の蛍光で逐次的に標識された反応生成物をレーザーで走査する方式であること。Ｄ フローセル上にＤＮＡ断片の増幅と固定化を自動的に行う装置を付随すること。データ解析サーバについて：Ｅ ＣＰＵ性能が、Dell社製Ｒ610Sever(8ＣＰＵ、48Ｇ ＲＡＭ)×3ユニット相当以上であること。Ｆストレージ性能が、 Isilon社製ＩＱ12000 Stor
- geモジュール×3ユニット相当以上であること。本調達には機器の据付、調整一式も含まれる。
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