病原体変異予測コンピュータシステム 一式
入札情報
- 品目分類：14
- 種別：意見招請
- 調達方法 購入等
- 導入目的 本システムは、北海道大学人獣共通感染症リサーチセンターが、文部科学省最先端研究基盤事業により、人獣共通感染症の病原体等の遺伝子変異およびタンパク質の構造変化を予測し、感染症の流行を先回りして予防する技術を確立するための大規模計算の基盤システムとして導入するものである。本システムの導入により、医学・獣医学に加え、生命情報学および計算科学の最先端技術を感染症研究に活用し、我が国の人獣共通感染症研究を加速させるものである。
- 導入予定時期 平成23年度3月以降
- 調達に必要とされる基本的な要求要件Ａ コンピュータシステムは、複数の計算ノードから構成される並列計算機であり、計算ノード1台の理論演算性能は、64ビット浮動小数点演算で 600Ｇ Flops以上、かつ、全体の理論演算性能は、64ビット浮動小数点演算で8ＴFlops以上であること。Ｂ 計算ノード1台の主記憶容量は、128ＧByte以上 で、総主記憶容量 は、 1.28 ＴByte以上であること。Ｃ 任意の計算ノード間のデータ転送速度は、計算ノードあたり8ＧByte以上であること。Ｄ 総容量 30ＴByte以上の磁気ディスク装置を備えること。Ｅ オペレーティングシステムは、ＵＮＩＸまたはＬＩＮＵＸであり、多様な生命情報学用ソフトウェアが利用できること。Ｆ 複数の計算ノードを利用し、生体分子の大規模分子動力学計算を高速に並列処理できること。Ｇ インタラクティブおよびバッチによる多重処理が可能であること。Ｈ 高速なネットワークからの利用が可能であること。Ｉ 並列高水準自動最適化ＦＯＲＴＲＡＮコンパイラ、Ｃコンパイラ、Ｃ＋＋コンパイラ、並列数値計算ライブラリ、並列通信ライブラリ、開発環境としてのデバックツールおよびチューニングツールが提供されること。
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